- Разные опенинги;

- Разные саундтреки на протяжении обоих фильмов, написанные разными композиторами;

- Разные покемоны в качестве второстепенных персонажей.

- У персонажа Дреада в "черном" фильме присутствует покемон Реюнайклус, в "белом" - Готитель.

- В "белом" фильме шайни-покемоном является Голурк Джанты, в "черном" - Гидрейгон Кариты.

- Левая и правая развилки на дороге в начале фильма.

- Корзинка с печеньями у Денто (Сайлана) в фильме с Реширамом красная, а в фильме с Зекромом синяя.

- Большинство основных сцен аналогичны друг другу.

- В версии с Реширамом Сатоши (Эш) делает гимнастические упражнения (?), когда подземелье начинает обрушаться; в версии с Зекромом он спасается, убегая.

- Битва между Реширамом и Зекромом в каждом фильме по-разному анимирована. Они используют разные атаки, в разное время, и по-разному их производя.

- Битва между Пикачу Сатоши и психическим покемоном Дреада проходит в обоих фильмах похоже.

- Печенья в фильмах постоянно меняют цвет. К примеру, в версии с Зекромом Сатоши бросает в океан розовое печенье, а в версии с Реширамом - белое.

- Есть и другие различия, еще не найденные автором статьи.